MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 chromosome 2

Total Repeats: 21730

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007494	GGA	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77464989
2	NC_007494	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77464989
3	NC_007494	GC	3	6	5806	5811	0 %	0 %	50 %	50 %	77464989
4	NC_007494	CCA	2	6	5820	5825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77464989
5	NC_007494	TGA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77464989
6	NC_007494	GAA	2	6	5855	5860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77464989
7	NC_007494	ACC	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77464989
8	NC_007494	CCG	2	6	5887	5892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464989
9	NC_007494	TGT	2	6	5896	5901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77464989
10	NC_007494	GCG	2	6	5964	5969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77464989
11	NC_007494	GAT	2	6	5973	5978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77464989
12	NC_007494	ATC	2	6	5986	5991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77464989
13	NC_007494	GAC	2	6	5994	5999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464989
14	NC_007494	GCC	2	6	6007	6012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464989
15	NC_007494	GCC	2	6	6036	6041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464989
16	NC_007494	CAG	2	6	6090	6095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464989
17	NC_007494	CGC	2	6	6165	6170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464989
18	NC_007494	ATG	2	6	6178	6183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77464989
19	NC_007494	GC	3	6	6371	6376	0 %	0 %	50 %	50 %	77464989
20	NC_007494	CCCG	2	8	6418	6425	0 %	0 %	25 %	75 %	77464989
21	NC_007494	GAA	3	9	6426	6434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77464989
22	NC_007494	GCG	2	6	6437	6442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77464989
23	NC_007494	CCG	2	6	6460	6465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464989
24	NC_007494	CAT	2	6	6495	6500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77464989
25	NC_007494	GGC	2	6	6543	6548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77464989
26	NC_007494	GCC	2	6	6553	6558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464989
27	NC_007494	GAC	2	6	6609	6614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464989
28	NC_007494	GAT	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77464989
29	NC_007494	GACC	2	8	6635	6642	25 %	0 %	25 %	50 %	77464989
30	NC_007494	CGA	2	6	6644	6649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464989
31	NC_007494	GAA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77464989
32	NC_007494	CGGC	2	8	6692	6699	0 %	0 %	50 %	50 %	77464989
33	NC_007494	CGG	2	6	6773	6778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77464989
34	NC_007494	GC	3	6	6787	6792	0 %	0 %	50 %	50 %	77464989
35	NC_007494	GCC	2	6	7055	7060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464990
36	NC_007494	GCG	2	6	7225	7230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77464991
37	NC_007494	CG	4	8	7255	7262	0 %	0 %	50 %	50 %	77464991
38	NC_007494	CTC	2	6	7301	7306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77464991
39	NC_007494	TCG	2	6	7360	7365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77464991
40	NC_007494	TCC	3	9	7437	7445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77464991
41	NC_007494	GC	3	6	7463	7468	0 %	0 %	50 %	50 %	77464991
42	NC_007494	ATC	2	6	7472	7477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77464991
43	NC_007494	CTC	2	6	7523	7528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77464991
44	NC_007494	TC	3	6	7560	7565	0 %	50 %	0 %	50 %	77464991
45	NC_007494	GCA	2	6	7594	7599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464991
46	NC_007494	GCG	3	9	7615	7623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77464991
47	NC_007494	GCG	2	6	7642	7647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77464991
48	NC_007494	TCGG	2	8	7680	7687	0 %	25 %	50 %	25 %	77464991
49	NC_007494	GGT	2	6	7689	7694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77464991
50	NC_007494	GGC	2	6	7705	7710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77464991
51	NC_007494	GCCA	2	8	7731	7738	25 %	0 %	25 %	50 %	77464991
52	NC_007494	GC	3	6	7739	7744	0 %	0 %	50 %	50 %	77464991
53	NC_007494	CATC	2	8	7750	7757	25 %	25 %	0 %	50 %	77464991
54	NC_007494	AGGC	2	8	7777	7784	25 %	0 %	50 %	25 %	77464991
55	NC_007494	TTG	2	6	7911	7916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77464991
56	NC_007494	GTC	2	6	7934	7939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77464991
57	NC_007494	CGA	2	6	7963	7968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464991
58	NC_007494	GCC	3	9	8526	8534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464992
59	NC_007494	GAA	2	6	8560	8565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77464992
60	NC_007494	CGC	2	6	8610	8615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464992
61	NC_007494	GGC	2	6	8635	8640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77464992
62	NC_007494	TGG	3	9	8992	9000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77464993
63	NC_007494	CCT	2	6	9116	9121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77464994
64	NC_007494	AGC	2	6	9148	9153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464994
65	NC_007494	TCGC	2	8	9243	9250	0 %	25 %	25 %	50 %	77464994
66	NC_007494	ACC	2	6	9260	9265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77464994
67	NC_007494	GCCA	2	8	9770	9777	25 %	0 %	25 %	50 %	77464995
68	NC_007494	CCG	2	6	9795	9800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464995
69	NC_007494	GCC	2	6	9878	9883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464995
70	NC_007494	GGCCG	2	10	9986	9995	0 %	0 %	60 %	40 %	77464995
71	NC_007494	ACG	2	6	10017	10022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464995
72	NC_007494	CGA	2	6	10051	10056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464995
73	NC_007494	ACT	2	6	10104	10109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77464995
74	NC_007494	GCG	2	6	10110	10115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77464995
75	NC_007494	ACG	2	6	10128	10133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464995
76	NC_007494	GCA	2	6	10134	10139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464995
77	NC_007494	CCT	2	6	10150	10155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77464995
78	NC_007494	GGCG	2	8	10177	10184	0 %	0 %	75 %	25 %	77464995
79	NC_007494	GCC	2	6	10227	10232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464995
80	NC_007494	GCG	2	6	10257	10262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77464995
81	NC_007494	CCG	2	6	10263	10268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464995
82	NC_007494	GCG	2	6	10279	10284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77464995
83	NC_007494	CGA	2	6	10294	10299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464995
84	NC_007494	AGA	2	6	10338	10343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77464995
85	NC_007494	GACC	2	8	10351	10358	25 %	0 %	25 %	50 %	77464995
86	NC_007494	AGC	2	6	10389	10394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464995
87	NC_007494	GTC	2	6	10397	10402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77464995
88	NC_007494	TCG	2	6	10422	10427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77464995
89	NC_007494	GGC	2	6	10434	10439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77464995
90	NC_007494	AGC	2	6	10587	10592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464995
91	NC_007494	GTG	2	6	10598	10603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77464995
92	NC_007494	TCG	2	6	10650	10655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77464995
93	NC_007494	TGCG	2	8	10671	10678	0 %	25 %	50 %	25 %	77464995
94	NC_007494	GC	3	6	10738	10743	0 %	0 %	50 %	50 %	77464995
95	NC_007494	TCC	2	6	10746	10751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77464995
96	NC_007494	ATC	2	6	10778	10783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77464995
97	NC_007494	GAG	2	6	10787	10792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77464995
98	NC_007494	TCC	2	6	10805	10810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77464995
99	NC_007494	CCT	2	6	10837	10842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77464995
100	NC_007494	GC	3	6	10843	10848	0 %	0 %	50 %	50 %	77464995
101	NC_007494	ACG	2	6	11013	11018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464995
102	NC_007494	GC	3	6	11042	11047	0 %	0 %	50 %	50 %	77464995
103	NC_007494	ACGGCG	2	12	11051	11062	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77464995
104	NC_007494	CGCTG	2	10	11070	11079	0 %	20 %	40 %	40 %	77464995
105	NC_007494	CG	3	6	11154	11159	0 %	0 %	50 %	50 %	77464995
106	NC_007494	ACT	2	6	11160	11165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77464995
107	NC_007494	TGC	2	6	11169	11174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77464995
108	NC_007494	CTT	2	6	11260	11265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77464995
109	NC_007494	CTCGC	2	10	11273	11282	0 %	20 %	20 %	60 %	77464995
110	NC_007494	CGA	2	6	11313	11318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464996
111	NC_007494	CCGA	2	8	11356	11363	25 %	0 %	25 %	50 %	77464996
112	NC_007494	TGG	2	6	11417	11422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77464996
113	NC_007494	CG	3	6	11468	11473	0 %	0 %	50 %	50 %	77464996
114	NC_007494	GCC	2	6	11516	11521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464996
115	NC_007494	CGA	2	6	11577	11582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464996
116	NC_007494	TCG	2	6	11606	11611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77464996
117	NC_007494	GCG	2	6	11622	11627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77464996
118	NC_007494	GCA	2	6	11628	11633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464996
119	NC_007494	GC	3	6	11663	11668	0 %	0 %	50 %	50 %	77464996
120	NC_007494	GCT	2	6	11748	11753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77464996
121	NC_007494	GAG	2	6	11764	11769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77464996
122	NC_007494	GCC	2	6	11915	11920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464996
123	NC_007494	CAG	2	6	11926	11931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464996
124	NC_007494	CGAG	2	8	11999	12006	25 %	0 %	50 %	25 %	77464996
125	NC_007494	CAG	2	6	12025	12030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77464996
126	NC_007494	AAG	2	6	12058	12063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77464996
127	NC_007494	CTCA	2	8	12070	12077	25 %	25 %	0 %	50 %	77464996
128	NC_007494	CG	3	6	12118	12123	0 %	0 %	50 %	50 %	77464996
129	NC_007494	CCG	2	6	12173	12178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464996
130	NC_007494	CG	3	6	12183	12188	0 %	0 %	50 %	50 %	77464996
131	NC_007494	GC	3	6	12305	12310	0 %	0 %	50 %	50 %	77464997
132	NC_007494	TCG	2	6	12379	12384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77464997
133	NC_007494	GCC	2	6	12386	12391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77464997
134	NC_007494	CGT	2	6	12392	12397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77464997
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138	NC_007494	GAT	2	6	12569	12574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77464997
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258	NC_007494	GC	3	6	19736	19741	0 %	0 %	50 %	50 %	77465004
259	NC_007494	CG	3	6	19767	19772	0 %	0 %	50 %	50 %	77465004
260	NC_007494	GGTGC	2	10	19793	19802	0 %	20 %	60 %	20 %	77465004
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262	NC_007494	GTG	2	6	19841	19846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77465004
263	NC_007494	GCG	2	6	19869	19874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77465004
264	NC_007494	CGG	2	6	19935	19940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77465004
265	NC_007494	CATC	2	8	20017	20024	25 %	25 %	0 %	50 %	77465004
266	NC_007494	CGA	2	6	20026	20031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77465004
267	NC_007494	ACGGA	2	10	20099	20108	40 %	0 %	40 %	20 %	77465005
268	NC_007494	CG	5	10	20140	20149	0 %	0 %	50 %	50 %	77465005
269	NC_007494	CGG	2	6	20156	20161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77465005
270	NC_007494	CGA	2	6	20235	20240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77465005
271	NC_007494	ATG	2	6	20302	20307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77465005
272	NC_007494	CGC	2	6	20325	20330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77465005
273	NC_007494	TCG	2	6	20345	20350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77465005
274	NC_007494	GCGG	2	8	20358	20365	0 %	0 %	75 %	25 %	77465005
275	NC_007494	GACC	2	8	20410	20417	25 %	0 %	25 %	50 %	77465005
276	NC_007494	CCG	2	6	20433	20438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77465005
277	NC_007494	C	6	6	20447	20452	0 %	0 %	0 %	100 %	77465005
278	NC_007494	GTG	2	6	20458	20463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77465005
279	NC_007494	CGG	2	6	20495	20500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77465005
280	NC_007494	GC	3	6	20507	20512	0 %	0 %	50 %	50 %	77465005
281	NC_007494	GCG	2	6	20546	20551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77465005
282	NC_007494	CGC	2	6	20586	20591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77465005
283	NC_007494	CG	3	6	20651	20656	0 %	0 %	50 %	50 %	77465005
284	NC_007494	CGC	2	6	20661	20666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77465005
285	NC_007494	TGC	2	6	20678	20683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77465005
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287	NC_007494	GTG	2	6	20839	20844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77465005
288	NC_007494	CGC	2	6	20860	20865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77465005
289	NC_007494	CGG	2	6	20882	20887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77465005
290	NC_007494	CTG	2	6	20893	20898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77465005
291	NC_007494	CTG	2	6	20947	20952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77465005
292	NC_007494	GGCG	2	8	20955	20962	0 %	0 %	75 %	25 %	77465005
293	NC_007494	ATC	2	6	21052	21057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77465005
294	NC_007494	GTG	2	6	21067	21072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77465005
295	NC_007494	CCG	2	6	21102	21107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77465005
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299	NC_007494	ATGC	2	8	21274	21281	25 %	25 %	25 %	25 %	77465005
300	NC_007494	AGC	2	6	21302	21307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77465005
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302	NC_007494	TCG	2	6	21428	21433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77465006
303	NC_007494	CG	4	8	21453	21460	0 %	0 %	50 %	50 %	77465006
304	NC_007494	TTG	2	6	21527	21532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77465006
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375	NC_007494	GC	3	6	24087	24092	0 %	0 %	50 %	50 %	77465010
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379	NC_007494	CTCGGC	2	12	24142	24153	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77465010
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381	NC_007494	CG	3	6	24311	24316	0 %	0 %	50 %	50 %	77465010
382	NC_007494	AGGC	2	8	24473	24480	25 %	0 %	50 %	25 %	77465010
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388	NC_007494	CG	4	8	24761	24768	0 %	0 %	50 %	50 %	77465011
389	NC_007494	TCGGCC	2	12	24781	24792	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77465011
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